突然、謎の物体がニューヨーク、セントラルパークに飛来する。巨大なドームのようなその物体は一体何なのか、アメリカ政府は、あらゆる分野の専門家を招集する。

集められた専門家の中に宇宙生物学者のヘレン（ジェニファー・コネリー）がいた。亡くなった夫の息子で、血のつながらないジェイコブ（ジェイデン・スミス）を育てるシングルマザーのヘレンは、幼いジェイコブから無理矢理引き離されて、政府のエージェントによってセントラルパークへと連れて行かれる。他の専門家と一緒にヘレンが謎のドームに近づいたその時、ドームから現れたのは、宇宙からの使者、クラトウ（キアヌ・リーブス）。

政府は、彼を敵対する者だとして厳重に監視し、尋問するが、クラトゥは特殊な能力で易々と警備をかいくぐって脱出、ヘレンに連絡を取る。

多感な年頃で、血のつながらないジェイコブと、多忙なヘレンはずっと気持ちがすれ違ってきたが、そこにいきなり謎の男、クラトゥが現れ、ジェイコブはますます心を閉ざしてしまう。

一体クラトゥは、何をしに地球に来たのか、人間の敵なのか、味方なのか、クラトゥと離す間に、ヘレンはクラトゥが地球に来た真の目的を知って愕然とする。

彼は地球を守るためにやってきた。そして、地球の最大の脅威は…我々人間。

監督：スコット・デリクソン
出演：キアヌ・リーブス、ジェニファー・コネリー、ジェイデン・スミス　他
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